聚类分析软件

聚类分析软件官方版软件主要用于血型、蛋白质多态、品种聚类等方面的统计分析，可自动进行杂合度、多态信息含量、遗传距离以及聚类的计算，并可自动画出聚类图。

聚类分析软件软件简介

　　本软件主要用于计算杂合度、多态信息含量、遗传距离以及聚类分析，适用于血型、蛋白质多态、品种聚类等方面。

　　若本软件所采用的计算公式不适合您，作者可以为您修改公式(收取一定费用，视公式的复杂程度)!

聚类分析软件主要功能

　　1、程序界面简洁明了，各项功能一目了然，无须学习便可直接使用!

　　2、命令介绍：

　　(1)数据读入及预处理命令

　　定义矩阵 ：定义数据矩阵的大小，用“长×宽”表示，X轴方向为品种，Y轴为数据;分类数(位点数)只在用Roger公式计算遗传距离时根据需要输入，系统默认值为“1”。如输入“5”ד4”“2”，即表示有5个品种，4行数据,2个基因位点。系统最多支持255个品种，9999条数据。

　　输入数据 ：按定义的矩阵创建一个空白矩阵，若没有定义矩阵大小，则按当前矩阵的大小创建空白矩阵。

　　读入数据 ：将通过“保存矩阵”命令保存到磁盘上的数据读入到系统，系统将自动创建一个大小与之相适应的矩阵，并将全部数据读入。

　　追加数据 ：在当前矩阵的尾部继续添加一个已保存的数据，主要用于计算遗传距离。

　　读入遗传距离 ：将保存到磁盘上的遗传距离数据读入,可直接用于聚类计算。

　　数据正规化 ：将当前矩阵中的数据按“标准差标准化法”进行处理。注意：点此命令后，在计算遗传距离和进行聚类计算都会使用经过处理后的数据。只有在重新读入或查看原始数据后才会恢复原始数据，再进行遗传距离和聚类计算就会按照原始数据进行计算。

　　(2)计算命令

　　计算杂合度 ：按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的杂合度。

　　计算多态性 ：按照Nei氏公式(1974)计算出各品种的多态信息含量。

　　计算欧氏距离 ：在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Roger公式计算出各品种之间的遗传距离。注：如未在“定义矩阵”中定义分类数(等位基因数)，则系统默认其值为1。在此情况下计算得出的遗传距离与使用Mahalanobis公式计算的遗传距离是一样的。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

　　计算遗传距离 ：在将各数据读入到系统后，可用此命令按照Nei氏公式(1983)计算出各品种之间的遗传距离。未注册用户最后3个品种的遗传距离不显示。

　　进行聚类计算 ：在已计算或读入遗传距离后，可用此命令按P.H.A.Sneath等(1973)的类平均聚类法(UPGMA法，又称非加权算术平均数成对聚类法)进行系统聚类。聚类结果说明：第1列No为序列号，代表是第几次聚类;第2列D为距离系数;第3、4列breed1、breed2为参于聚类的两个品种，第5列Cluster为聚类后的新名称，第6列Content为两品种的名称。未注册用户最后3次聚类结果不显示。

　　(3)数据查看及保存命令

　　查看原始数据 ：将原始数据读入到当前矩阵中。并清除正规化处理过的数据。

　　查看遗传距离 ：将读入的遗传距离或经过计算得到的遗传距离在当前矩阵中显示。

　　查看聚类图 ：按照聚类后的结果自动画出聚类图。

　　保存聚类图 ：将显示的聚类图以图象文件保存到磁盘上。未注册用户无此功能!

　　保存矩阵 ：将当前矩阵保存到磁盘上。若当前矩阵为原始数据，则保存原始数据;若为经过正规化处理过的数据，则保存经过处理的数据;若为杂合度，则保存杂合度;......;若为聚类结果，则保存聚类结果。未注册用户无此功能!

　　数据导出 ：系统自动判断当前所有矩阵中所含的数据，并将其导出为Excel文件。未注册用户无此功能!

　　(4)帮助与退出命令

　　帮助 ：显示本文件。

　　退出 ：按此命令后退出系统!

聚类分析软件运行环境

　　1、硬件环境:

　　硬件名称 最低配置 建议配置

　　1).CPU中央处理器 586 奔腾PⅡ以上或兼容芯片

　　2).内存 　 32M 64M以上

　　3).硬盘自由空间 1M 10M以上

　　4).显示器 VGA真彩 SUPER VGA或液晶显示

　　2、软件环境:

　　操作系统: Windows95/98/Me/Nt/2000/Xp

　　并安装有Excel97及以上版本的办公软件，否则数据无法导出为Excel格式的文件。

　　3、推荐使用：Win2000或Xp操作系统+Office2000。

聚类分析软件安装步骤

　　1、在番茄下载站站下载聚类分析软件官方版这款软件的压缩包，解压后，双击exe，进入安装界面，点击下一步

　　2、设置软件安装位置，点击浏览可以修改默认在C盘的安装位置，建议大家选择安装在D盘，然后点击下一步

　　3、选择持续文件夹，默认即可，点击下一步

　　4、选择是否创建软件快捷方式，选择是，点击下一步

　　5、确认软件安装信息，点击下一步

　　6、聚类分析软件官方版软件正在安装，等待完成即可

聚类分析软件使用方法

　　如何定义矩阵?

　　1、运行软件，点击“定义矩阵”

　　2、设置矩阵大小

　　3、点击确定即可

聚类分析软件常见问题

　　如何查看聚类分析软件官方版的帮助文件?

　　在聚类分析软件官方版软件主页点击“帮助”即可快速查看帮助文件

聚类分析软件更新日志

开发GG说这次真的没有bug了~